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生物能源研究团队对猕猴基因组进行测序

导读 一个国际研究小组已对装饰性花蜜(Mcanthus)的全基因组进行了测序,这是一种野生的多年生草,正在成为可持续生物能源作物的主要候选植物。该

一个国际研究小组已对装饰性花蜜(Mcanthus)的全基因组进行了测序,这是一种野生的多年生草,正在成为可持续生物能源作物的主要候选植物。

该基因组计划通过在中心高级生物能源和生物产品创新(CABBI)的科学家为主导,能源的能源部(DOE)生物能源研究中心为研究人员提供探索新的途径,以最大限度地提高工厂的生产效率和破译遗传基础的路线图因其理想的特性。

这项研究发表在《自然通讯》上,由CABBI研究人员丹尼尔·罗克萨尔(Daniel Rokhsar)监督,丹尼尔·罗克萨尔(Daniel Rokhsar)是加州大学伯克利分校分子与细胞生物学系教授;以及阿拉巴马州亨茨维尔哈德逊阿尔法生物技术研究所的教职研究员Kankshita Swaminathan(如图)。该团队由40多位合作者组成,由Rokhsar实验室的Therese Mitros,Adam Session和Guohong Albert Wu领导。和来自Swaminathan实验室的Brandon James。Mitros和James是CABBI的研究人员,Session和Wu隶属于DOE联合基因组研究所(JGI),该研究所是DOE科学办公室的劳伦斯伯克利国家实验室(伯克利实验室)用户设施。

芒草还用于花园,造纸和屋顶,是一种有前途的生物质资源,可替代石油基化石燃料。它们属于Andropogoneae草类,其中包括玉米,高粱和甘蔗,这些植物都是高产且具有全球重要性的植物,可作为食物,饲料和生物燃料的来源。

芒草适应性强,易于生长。它可以在边缘土地上繁衍生息,只需要有限的施肥,对干旱和凉爽的温度具有很高的耐受性,并使用更有效的C4形式的光合作用。

CABBI团队对中华芒(Miscanthus sinensis)的序列和基因组分析(任何类型的芒草都是第一个),为系统改进以优化这些理想性状奠定了基础。该项目还产生了一个基因图集,这些图集在植物的季节性生命周期中在植物的不同部分打开和关闭,揭示了多年生性的新调节剂,这是生物燃料和其他农作物的理想特性。

斯瓦米纳坦说:“我们为猕猴组装的基因组工具包将成为研究人员研究该植物并将其育种以提高生物量和其他性状的宝贵资源。” “通过比较桔梗与高粱,甘蔗和其他相关草,CABBI内外的研究人员甚至希望破译与生产力和适应性相关的创新的遗传基础。”